Mécanique moléculaire

La mécanique moléculaire correspond à l'utilisation de la mécanique newtonienne pour modéliser des systèmes moléculaires.

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Chimie générale - Mécanique - Techniques et sciences appliquées

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LA MECANIQUE MOLECULAIRE. La structure 3D d'une molécule résulte des interactions intramoléculaires et des interactions avec le solvant.... (source : pro.chemist.online)
(Isaac) Newton & la dynamique moléculaire.... Mots clés : forces, mécanique classique, gravité, simulation de dynamique moléculaire, ... (source : cnrs)

La mécanique moléculaire correspond à l'utilisation de la mécanique newtonienne pour modéliser des systèmes moléculaires. Les approches de la mécanique moléculaire sont fréquemment appliquées pour le perfectionnement des structures moléculaires, les simulations de dynamique moléculaire et les simulations par la méthode de Monte-Carlo.

Typiquement, les modèles de mécanique moléculaire consistent en des atomes sphériques reliés par des ressorts qui représentent les liaisons. Les forces internes reconnues dans la structure modélisée sont décrites en utilisant de simples fonctions mathématiques. La loi de Hooke est le plus souvent employée pour décrire les interactions de liaison. Les atomes peuvent être traités comme des sphères dures non-élastiques ou ils peuvent interagir selon le potentiel de Lennard-Jones.

Voir aussi

Champ de force

Logiciels

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Références

U. Burkert and N. L. Allinger, Molecular Mechanics, 1982, ISBN 0841208859
O. Becker, A. D. MacKerell, Jr., B. Roux and M. Watanabe, Editors, Computational Biochemistry and Biophysics, Marcel Dekker Inc., New York, 2001, ISBN 082470455X
MacKerell, A. D., Jr., Empirical Force Fields for Biological Macromolecules : Overview and Issues, Journal of Computational Chemistry, 25 : 1584-1604, 2004

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