Jmol

Jmol est un logiciel libre de visualisation de structures chimiques en 3D. Il est essentiellement utilisé par les étudiants, les professeurs et les chercheurs en chimie et en biologie structurale.


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Chémoinformatique - Représentation des molécules - Chimie générale - Plateforme Java - Logiciel libre sous licence LGPL - Logiciel utilisé en chimie

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  • Le cœur du logiciel est hébergé dans notre centre de données, ...... Jmol est un outil de visualisation de molécules gratuit, open source, multi-plateformes... (source : blogsavoir.spaces.live)
Jmol
Jmol logo.jpg
Jmol screenshot streptavidin.png
Molécule de Streptavidine
Développeur L'équipe de développement de Jmol
Dernière version
Version avancée
Environnement Multiplate-forme
Langues Multilingue[1]
Type Chemo-informatique
Licence GNU Lesser General Public License
Site Web Site de Jmol

Jmol est un logiciel libre de visualisation de structures chimiques en 3D. Il est essentiellement utilisé par les étudiants, les professeurs et les chercheurs en chimie et en biologie structurale. Il est développé en Java et est multi-plateformes. Ainsi, il fonctionne sous Windows, Mac OS X, Linux et les dispositifs Unix. Le logiciel est disponible sous trois formes :

Le logiciel Jmol supporte de nombreux modes de visualisation :

De plus, Jmol peut lire de nombreux formats de fichiers, y compris les fichiers Protein Data Bank (pdb), Crystallographic Information File (cif), MDL Molfile (mol) et Chemical Markup Language (CML).

L'applet Jmol offre une alternative libre et multiplate-forme au plugin Chime[2], qui n'est plus maintenu. Quoique possédant de nombreuses fonctions qui ne sont pas disponible dans Chime, le logiciel Jmol n'a pas pour objectif d'apporter l'ensemble des fonctionnalités de Chime (en particulier, le mode Sculpt). Chime nécessite l'installation d'un plugin et Internet Explorer 6.0 ou Firefox 2.0 avec le dispositif Microsoft Windows, ou OS 9/Netscape Communicator 4.8 avec le dispositif Macintosh. Jmol nécessite l'installation de Java et fonctionne sur une grande variété de plates-formes. A titre d'exemple, Jmol est entièrement fonctionnel avec Mozilla Firefox, Internet Explorer, Opera et Google Chrome sur le dispositif Microsoft Windows, Mozilla Firefox sur le dispositif Linux et Safari sur le dispositif Mac OS X.

Voir aussi

Références

  1. Traductions de Jmol
  2. (en) A. Herræz, Biomolecules in the Computer : Jmol to the Rescue, vol.  34, t.  4, 2006, 7 p. [lire en ligne] [présentation en ligne] 

Liens externes

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La version présentée ici à été extraite depuis cette source le 30/11/2010.
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